反相色譜柱基質：
　　
　　一般為硅膠，無機物剛性大，不易溶脹，高或低pH下, 硅膠會溶解，多用于小分子分離；也有聚合物基質，有機物剛性較小，孔結構復雜,孔徑不均勻導致柱效不夠高,疏水性強，整個pH范圍穩定，有機溶劑可能導致聚合物基質溶脹而受損，多用于大分子分離。還有氧化鋁和氧化鋯基質等。