高效液相色譜流動相過濾效果不好可能是由于以下原因之一：

1. 過濾器選擇不當：選擇的過濾器孔徑過大或過小，都會影響過濾效果。如果過濾器孔徑過大，流動相中的顆粒和細菌可能無法被完全過濾掉，從而影響液相色譜的分析結果。如果過濾器孔徑過小，流動相的流動速度可能會受到影響，從而影響液相色譜的分析速度。

2. 過濾器使用不當：在使用過濾器時，需要按照正確的方法進行安裝和使用。如果過濾器安裝不正確，或者使用過程中出現破損或堵塞，都會影響過濾效果。

3. 流動相質量不佳：流動相中含有顆粒、細菌或其他污染物，也會影響過濾效果。如果流動相質量不佳，即使使用了正確的過濾器，也可能無法完全過濾掉污染物。

4. 流動相溫度過高：流動相的溫度過高也會影響過濾效果。過高的溫度可能會導致過濾器的過濾膜變形或損壞，從而影響過濾效果。

為了提高高效液相色譜流動相的過濾效果，可以采取以下措施：

1. 選擇合適的過濾器：根據流動相的性質和分析物的要求，選擇合適的過濾器。通常建議選擇孔徑為 0.2 μm 或更小的過濾器。

2. 正確使用過濾器：在使用過濾器時，需要按照正確的方法進行安裝和使用。

3. 確保流動相質量：在使用流動相之前，需要對流動相進行過濾和脫氣處理，以確保流動相的質量。

4. 控制流動相溫度：在使用流動相時，需要控制流動相的溫度，以避免溫度過高對過濾效果的影響。

需要注意的是，高效液相色譜流動相的過濾效果是保證液相色譜分析結果準確性和可靠性的重要因素之一。如果過濾效果不好，可能會導致液相色譜的分析結果出現偏差或不準確，因此需要重視流動相的過濾效果。